Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms