Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RYKP34925 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RYKP34925 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RYKP34925 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RYKP34925 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RYKP34925 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RYKP34925 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RYKP34925 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms