Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID4AP29374 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms