Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHATP28329 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHATP28329 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHATP28329 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHATP28329 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms