Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-DMAP28067 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms