Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNMT1P26358 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DNMT1P26358 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms