Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTX3P26022 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms