Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFKBIAP25963 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms