Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF3P20783 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTF3P20783 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTF3P20783 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTF3P20783 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTF3P20783 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTF3P20783 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NTF3P20783 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NTF3P20783 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NTF3P20783 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NTF3P20783 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NTF3P20783 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NTF3P20783 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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