Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMNB1P20700 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms