Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB4AP20338 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4AP20338 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms