Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPI1P17947 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPI1P17947 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms