Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms