Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMP3P12645 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BMP3P12645 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms