Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP1P11387 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1P11387 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1P11387 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP1P11387 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP1P11387 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms