Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CGB3P0DN86 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CGB3P0DN86 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms