Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFTA3P0C7M3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms