Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOEP02649 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOEP02649 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOEP02649 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOEP02649 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms