Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX6O95475 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX6O95475 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms