Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCELO95171 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCELO95171 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCELO95171 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCELO95171 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCELO95171 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCELO95171 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCELO95171 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCELO95171 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCELO95171 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms