Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBOX1O75936 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BBOX1O75936 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms