Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSO75390 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSO75390 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSO75390 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSO75390 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSO75390 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CSO75390 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSO75390 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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