Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCN2BO60939 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms