Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DENRO43583 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DENRO43583 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DENRO43583 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DENRO43583 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DENRO43583 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms