Protein–RNA interactions for Protein: O43399

TPD52L2, Tumor protein D54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L2O43399 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TPD52L2O43399 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms