Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF3O43395 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF3O43395 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms