Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGFO15240 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGFO15240 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGFO15240 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGFO15240 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VGFO15240 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGFO15240 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGFO15240 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGFO15240 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms