Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms