Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP23O00161 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP23O00161 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms