Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NOTOA8MTQ0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms