Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HELTA6NFD8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms