Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ8

KRTAP4-9, Keratin-associated protein 4-9, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-9Q9BYQ8 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 CERS3-201ENST00000284382 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 EYA1-201ENST00000303824 3930 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 MED23-204ENST00000368060 4446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC02021-203ENST00000514145 569 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 SCMH1-206ENST00000372596 3323 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 GRIA3-209ENST00000622768 5173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-9Q9BYQ8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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KRTAP4-9Q9BYQ8 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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