Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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LHX8Q68G74 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LHX8Q68G74 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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