Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EDAR-201ENST00000258443 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 COL14A1-203ENST00000309791 6163 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP13-221ENST00000560579 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM29-201ENST00000341846 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRN-204ENST00000423636 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CA13-201ENST00000321764 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CD302-202ENST00000429078 3803 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF569-201ENST00000316950 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF596-203ENST00000398612 2863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A3P-201ENST00000506444 1395 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A4P-201ENST00000509856 1395 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPAP3-201ENST00000005386 4370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114811.2-201ENST00000569927 5647 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HIP1-207ENST00000616821 3120 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRB3-201ENST00000299267 4494 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PALB2-206ENST00000568219 3963 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9A3P1-201ENST00000426317 1685 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02068-201ENST00000418839 3212 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF5-213ENST00000489702 2988 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NR4A1-206ENST00000545748 3511 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL6-202ENST00000393382 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAM2-210ENST00000528391 3349 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL6-201ENST00000341319 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A20-201ENST00000353278 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF648-201ENST00000339948 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM184C-201ENST00000296582 4178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN3-218ENST00000635466 5254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms