Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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SH3BP1Q9Y3L3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1Q9Y3L3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SH3BP1Q9Y3L3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SH3BP1Q9Y3L3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SH3BP1Q9Y3L3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SH3BP1Q9Y3L3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP1Q9Y3L3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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