Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRPL11Q9Y3B7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms