Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1DQ9Y2S0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms