Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM2AQ9Y2K7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms