Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ICE1Q9Y2F5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ICE1Q9Y2F5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms