Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTNND2Q9UQB3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTNND2Q9UQB3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms