Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms