Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF18Q9UNG2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms