Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCAN3Q9UKA8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCAN3Q9UKA8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms