Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH4Q9UIA0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms