Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB2Q9UBS0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB2Q9UBS0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms