Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPS29Q9UBQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms