Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms