Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK12Q9NYV4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms