Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL28Q9NXS3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms