Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDL2Q9NX52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms